国家医学教育发展中心的首任主任是我国老一辈医学教育家、原北京医科大学校长马旭教授。现任主任是我国医学教育家、中国高等教育学会医学教育专业委员会名誉会长、中华医学会医学教育分会名誉主任委员、《中国高等医学教育》杂志名誉主编王镭教授
中心宗旨

对国家的医学教育发展方针、政策及医药院校的发展建设进行宏观研究，并向主管部门提出各种意见和建议；对医药院校的办学方针、专业设置、学科建设、教学改革及教学质量评估进行具体研究并提出各种意见和建议；适应和深化医学教育改革、创新，面向全国培养高等医学教育人才、医学学科带头人、教育管理干部和科研人员，提高我国医学科研、教育的素质和水平，推动我国医学教育及卫生事业的改革与发展，促进我国医、教、研模式的完善和创新，完成中华人民共和国卫生部和中华人民共和国教育部下达的工作任务，实现国家成立中心的初衷；同时组织医学教育研究的国内外学术交流，各级医学教育管理干部、教师和研究人员的培训。

中心主要任务

1、培养医学教育人才、管理干部、科研人员、学科带头人；

2、通过与国外知名医学科研教育机构的合作、交流开办医学教育、管理双硕士研究班，促进我国学科建设；

3、对全国高等医学院校办学方针、政策进行宏观研究，为国家制订医、教、研方针、政策提供可行性报告，为各医学高校提出教学建议；

4、对各高等医学院校的教研内容、方法、质量进行科学的评估，促进我国医、教、研模式的完善与创新；

5、承担国家教育部、国家卫生部、省高教厅、省卫生厅、高等医学院校的课题制订与研究工作；

6、组织国家医、教、研的国内外学术交流工作，开展各类长期、短期培训班、研修班工作；

7、开展继续医学教育工作；

8、开展全国性大型医药学术会议等。